Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms