Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms