Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfiaQ02780 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms