Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GscQ02591 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GscQ02591 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GscQ02591 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GscQ02591 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GscQ02591 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GscQ02591 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GscQ02591 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GscQ02591 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GscQ02591 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GscQ02591 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GscQ02591 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GscQ02591 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GscQ02591 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GscQ02591 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GscQ02591 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GscQ02591 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GscQ02591 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GscQ02591 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GscQ02591 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms