Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms