Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcqQ02111 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms