Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms