Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms