Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a2Q01149 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms