Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serpina1cQ00896 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms