Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga4Q00651 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms