Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
F8a1Q00558 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
F8a1Q00558 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms