Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brca2P97929 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brca2P97929 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brca2P97929 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms