Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms