Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms