Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms