Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms