Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms