Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms