Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb1P70662 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb1P70662 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms