Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shox2P70390 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms