Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms