Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msx3P70354 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx3P70354 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms