Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cux2P70298 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux2P70298 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux2P70298 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux2P70298 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux2P70298 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux2P70298 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cux2P70298 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms