Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp7P70280 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms