Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NficP70255 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NficP70255 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NficP70255 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NficP70255 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NficP70255 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NficP70255 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NficP70255 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NficP70255 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NficP70255 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NficP70255 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NficP70255 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NficP70255 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NficP70255 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NficP70255 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NficP70255 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NficP70255 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NficP70255 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NficP70255 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NficP70255 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NficP70255 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms