Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf5P70191 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf5P70191 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf5P70191 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf5P70191 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms