Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms