Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tubb4bP68372 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms