Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms