Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms