Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms