Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta2P62737 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms