Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lmo4P61969 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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