Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms