Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms