Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga11P61622 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms