Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr1aP61164 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr1aP61164 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr1aP61164 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr1aP61164 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr1aP61164 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr1aP61164 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr1aP61164 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr1aP61164 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actr1aP61164 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms