Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PlnP61014 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PlnP61014 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PlnP61014 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PlnP61014 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PlnP61014 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PlnP61014 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PlnP61014 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PlnP61014 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms