Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms