Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms