Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CgnP59242 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CgnP59242 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CgnP59242 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CgnP59242 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CgnP59242 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CgnP59242 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CgnP59242 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CgnP59242 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CgnP59242 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CgnP59242 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CgnP59242 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CgnP59242 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CgnP59242 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CgnP59242 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CgnP59242 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CgnP59242 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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