Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp4P59240 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms