Protein–RNA interactions for Protein: P59108

Cpne2, Copine-2, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne2P59108 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne2P59108 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms