Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp3P59055 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms