Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps33bP59016 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms