Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm6sf1P58749 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm6sf1P58749 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms