Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P58686 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P58686 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P58686 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P58686 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P58686 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P58686 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P58686 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P58686 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 586.5 ms