Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms