Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2c40P56657 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2c40P56657 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms